Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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