Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms