Protein–RNA interactions for Protein: O35980

Nthl1, Endonuclease III-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nthl1O35980 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nthl1O35980 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nthl1O35980 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nthl1O35980 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms