Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gp1baO35930 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms