Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RaxO35602 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RaxO35602 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RaxO35602 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RaxO35602 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RaxO35602 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RaxO35602 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RaxO35602 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms