Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6aO35464 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms