Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Atf6bO35451 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atf6bO35451 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atf6bO35451 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atf6bO35451 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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