Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh2d1bO35324 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh2d1bO35324 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh2d1bO35324 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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