Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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