Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hps1O08983 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hps1O08983 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms