Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms