Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm2035J3QP87 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm2035J3QP87 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm2035J3QP87 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm2035J3QP87 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms