Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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