Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem200cJ3QK46 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms