Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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