Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms