Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd50F7BE84 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd50F7BE84 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms