Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms