Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm340F6RGI3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms