Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms