Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms