Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrp3E9Q1T6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms