Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3250E9Q1M3 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms