Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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