Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Ccdc6D3YZP9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Ccdc6D3YZP9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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