Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms