Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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