Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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