Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cspp1B2RX88 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms