Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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