Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms