Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms