Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms