Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap221A9Q751 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap221A9Q751 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms