Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Rtf1A2AQ19 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Rtf1A2AQ19 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Rtf1A2AQ19 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Rtf1A2AQ19 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Rtf1A2AQ19 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rtf1A2AQ19 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rtf1A2AQ19 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms