Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms