Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms