Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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LHX9Q9NQ69 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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LHX9Q9NQ69 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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LHX9Q9NQ69 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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LHX9Q9NQ69 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
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LHX9Q9NQ69 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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LHX9Q9NQ69 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
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LHX9Q9NQ69 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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LHX9Q9NQ69 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LHX9Q9NQ69 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
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