Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 MIR7847-201ENST00000610912 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRAC1Q96KF2 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRAC1Q96KF2 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms