Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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BEST4Q8NFU0 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
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BEST4Q8NFU0 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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BEST4Q8NFU0 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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BEST4Q8NFU0 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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