Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEL0

CCDC54, Coiled-coil domain-containing protein 54, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC54Q8NEL0 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC54Q8NEL0 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC54Q8NEL0 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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