Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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PTPRNQ16849 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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PTPRNQ16849 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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PTPRNQ16849 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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PTPRNQ16849 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PTPRNQ16849 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPRNQ16849 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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PTPRNQ16849 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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PTPRNQ16849 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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PTPRNQ16849 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRNQ16849 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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