Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMN1Q16637 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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