Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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CNGA3Q16281 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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CNGA3Q16281 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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CNGA3Q16281 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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CNGA3Q16281 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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CNGA3Q16281 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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CNGA3Q16281 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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CNGA3Q16281 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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CNGA3Q16281 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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CNGA3Q16281 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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CNGA3Q16281 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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CNGA3Q16281 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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CNGA3Q16281 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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CNGA3Q16281 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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CNGA3Q16281 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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CNGA3Q16281 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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CNGA3Q16281 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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