Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF1Q15637 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF1Q15637 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SF1Q15637 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF1Q15637 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF1Q15637 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF1Q15637 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF1Q15637 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF1Q15637 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF1Q15637 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF1Q15637 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SF1Q15637 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SF1Q15637 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SF1Q15637 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SF1Q15637 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SF1Q15637 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF1Q15637 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF1Q15637 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF1Q15637 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SF1Q15637 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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