Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SYCP1Q15431 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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SYCP1Q15431 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
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SYCP1Q15431 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SYCP1Q15431 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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SYCP1Q15431 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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SYCP1Q15431 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
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SYCP1Q15431 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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SYCP1Q15431 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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