Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERPUD1Q15011 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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