Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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IRF3Q14653 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
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IRF3Q14653 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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IRF3Q14653 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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IRF3Q14653 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IRF3Q14653 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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IRF3Q14653 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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IRF3Q14653 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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IRF3Q14653 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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IRF3Q14653 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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IRF3Q14653 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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