Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGB1Q14028 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGB1Q14028 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.8 ms