Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
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CKAP5Q14008 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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